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Biopole

UMR7365 CNRS-Université de Lorraine
Ingénierie Moléculaire et Physiopathologie Articulaire (IMoPA)
Biopôle, Campus Brabois-Santé
9 Avenue de la Forêt de Haye, BP 20199
54505 VANDOEUVRE-LES-NANCY

yuri.motorin [at] univ-lorraine.fr +33 3.72.74.66.29 Anglais, Français, Russe / UMR7365 IMoPA

compétences

  • Biologie Moléculaire
  • Spécialiste des ARN
  • Modifications post-transcriptionnelles des ARN (Epitranscriptomique)
  • Séquençage à haut-débit
  • Bioinformatique

Biographie

Diplômes

  • 1999 : Habilitation à Diriger les Recherches (HDR), Université Paris Sud, Orsay
  • 1989 : Doctorat en Chimie (spécialisation biochimie), Institut de Biochimie A.N. Bakh, Académie des Sciences de Russie, Moscou. Sujet "Complexe multiprotéique de la valyl-ARNt synthétase et du facteur d'élongation (EF-1H) de cellules de mammifères: purification et caractérisation". Thèse soutenue le 19 octobre 1989
  • 1985-1989 : Préparation de la thèse de Doctorat en Sciences, Laboratoire de Biochimie de l'Evolution, Institut de Biochimie A.N. Bakh, Académie des Sciences de Russie, Moscou
  • 1985 : Diplôme d'Etudes Universitaires d'Etat (DEA), Université Lomonossov de Moscou, Laboratoire de Biochimie de l'Evolution, Institut de Biochimie A.N. Bakh, Académie des Sciences de Russie, Moscou.

Expériences
professionnelles

  • 2000-Présent : Professeur de Biologie Moléculaire à l’Université de Lorraine, Nancy, France. Laboratoire ARN-RNP Maturation-Structure-Fonction, Enzymologie Moléculaire et Structurale (AREMS) UMR 7214 CNRS-UHP, puis Ingénierie Moléculaire et Physiopathologie Articulaire (IMoPA) UMR7365 CNRS-Université de Lorraine. Co-direction de l’équipe « ARN-RNP Maturation-Structure-Fonction » axe « Modifications post-transcriptionnelles des ARN ».
  • 1999-2000 : Chercheur associé (CR-A, Poste Rouge CNRS, puis Chaire industrielle), Laboratoire de Maturation des ARN et Enzymologie Moléculaire, UMR 7567 UHP-CNRS, Faculté des Sciences, Nancy 1, Nancy, France. Sujet de recherche "Identification et caractérisation de pseudouridine-synthases de levure". Equipe du Dr. C. BRANLANT
  • 1998-1999 : Chercheur associé (CR-A, Poste Rouge CNRS), Laboratoire d'Enzymologie du CNRS, Gif-sur-Yvette, France. Sujet de recherche "Identification, clonage et caractérisation de pseudouridine-synthases et méthyl-transférases de levure". Equipe du Dr. H. GROSJEAN
  • 1996-1997 : Postdoc, Laboratoire d'Enzymologie du CNRS, Gif-sur-Yvette, France. Sujet de recherche "Formation des pseudouridines dans les ARN de levure". Equipe du Dr. H. GROSJEAN
  • 1994-1995 : Postdoc, Laboratoire d'Enzymologie du CNRS, Gif-sur-Yvette, France. Sujet de recherche "Formation enzymatique de nucléotides modifiés dans l'ARNtSer d'E.coli: étude sur les résidus ms2i6A37 et D20". Equipe du Dr. H. GROSJEAN
  • 1993-1994 : Postdoc, Laboratoire d'Enzymologie du CNRS, Gif-sur-Yvette, France. Sujet de recherche "Purification et caractérisation de la cystéinyl-ARNt synthétase de levure et de foie de lapin et de la glycyl-ARNt synthétase de foie de lapin". Equipe du Dr. J.-P. WALLER
  • 1991-1993 : Chercheur à l'Institut de Biochimie A.N. Bakh, Académie des Sciences de Russie, Moscou. Sujet de recherche "Etude d'éléments d'identité impliqués dans la reconnaissance de l'ARNtPhe par la phénylalanyl-ARNt synthétase et du mécanisme de reconnaissance"
  • 1992 : Postdoc, Laboratoire d'Enzymologie du CNRS, Gif-sur-Yvette, France. Sujet de recherche "Etude de l'autophosphorylation de protéines de cellules de mammifères". Equipe du Dr. J.-P. WALLER
  • 1989-1991 : Chercheur à l'Institut de Biochimie A.N. Bakh, Académie des Sciences de Russie, Moscou
  • 1985-1989 : Ingénieur de Recherche/Chercheur Junior à l'Institut de Biochimie A.N. Bakh, Académie des Sciences de Russie, Moscou

Responsabilité(s),
Expertise(s)
scientifiques

  • Directeur de l'UMS2008 IBSLor, CNRS-UL-INSERM
  • Co-direction de l'équipe 1 "ARN-RNP, Structure-Fonction-Maturation" du laboratoire IMoPA (UMR7365 CNRS-Université de Lorraine) et animation de l'axe "Développement de nouvelles technologies à haut-débit pour l'analyse des modifications post-transcriptionnelles des ARN"
  • Membre du comité de pilotage pour l'action européenne COST EPITRAN (2017-2021)
  • Partenaire scientifique Projet ANR - PRC "RiboMet" (2021-2024)
  • Coordinateur Projet Régional FRCR "ViroMod" (2021-2024)
  • Membre d'Editorial Board pour les journaux Scientific Reports (Nature Group) et Genes

  • Expert pour différents journaux (Nature, Nature Biotechnology, Nucleic Acids Research, Scientific Reports, WIRES RNA, RNA Biology, RNA, PLoS One, BMC Biochemistry, International Journal of Molecular Sciences / Reactome website, Methods Elsevier, Genes)

  • Activité d'expertise dans les instances nationales et internationales (Expert pour l'évaluation de projets ANR-France, DFG-Allemagne, HSFP-EC, Austrian Sicence Foundation, BBSRC UK, German-Israeli Foundation

recherche

Thématique
de recherche

  • Depuis septembre 2000, étude des modifications post-transcriptionnelles présentes dans les ARN
    • Etude et caractérisation d'une nouvelle famille d'ARN:pseudouridine-synthases L'ensemble des travaux sur cette famille ont permis de découvrir plusieurs nouvelles activités responsables de la formation des pseudouridines dans l'ARNr mitochondrial et dans les ARNt. 
    • Etude et caractérisation d'une ARN:pseudouridine-synthase multifonctionnelle qui est responsable de la formation des résidus pseudouridines dans les ARNt, le snRNA U2 et l’ARNr 5S chez la levure S. cerevisiae
    • Etude des ARN:m5C-méthyltransférases
  • En 2008-2009, projet de collaboration avec l'équipe du Dr Mark Helm à l'Université de Heidelberg en Allemagne
    • Préparation de réactifs chimiques pour le marquage spécifique des ARN 
  • Depuis 2011, en collaboration avec Pr Mark Helm, Développement de techniques à haut-débit pour permettre l'identification et la caractérisation des modifications des ARN à grande échelle
    • Développement de RT-seq (m1A)
    • Développement de RiboMethSeq (2'-O-Me)
    • Développement d'AlkAnilineSeq (m3C and m7G)
    • Développement d'HydraPsiSeq (Psi)

Résultats
majeurs

  • Développement de techniques à haut-débit pour l'étude des nucléotides modifiés
    1. Ringeard M, Marchand V, Decroly E, Motorin Y, Bennasser Y. FTSJ3 is an RNA 2'-O-methyltransferase recruited by HIV to avoid innate immune sensing. Nature. 2019 Jan 9. doi: 10.1038/s41586-018-0841-4. PMID:30626973.
    2. Marchand V, Pichot F, Neybecker P, Ayadi L, Bourguignon-Igel V, Wacheul L, Lafontaine DLJ, Pinzano A, Helm M, Motorin Y. HydraPsiSeq: a method for systematic and quantitative mapping of pseudouridines in RNA. Nucleic Acids Res. 2020 Sep 25 : gkaa769. doi:10.3390/genes11080950
    3. Marchand V, Ayadi L, Ernst FGM, Hertler J, Bourguignon-Igel V, Galvanin A, Kotter A, Helm M, Lafontaine DLJ, Motorin Y. AlkAniline-Seq: Profiling of m(7)G and m(3)C RNA Modifications at Single Nucleotide Resolution. Angew Chem Int Ed Engl. 2018 Dec 17 ; 57(51):16785-16790. doi: 10.1002/anie.201810946. PMID: 30370969.
    4. Marchand V, Blanloeil-Oillo F, Helm M, Motorin Y. Illumina-based RiboMethSeq approach for mapping of 2'-O-Me residues in RNA. Nucleic Acids Res. 2016 Sep19 ; 44(16):e135. doi: 10.1093/nar/gkw547. PMID: 27302133.
  • Etude et caractérisation de m5C-méthyltransférases
    1. Bourgeois G, Ney M, Gaspar I, Aigueperse C, Schaefer M, Kellner S, Helm M, Motorin Y. Eukaryotic rRNA Modification by Yeast 5-Methylcytosine-Methyltransferases and Human Proliferation-Associated Antigen p120. PLoS One. 2015 Jul 21 ; 10(7):e0133321. doi: 10.1371/journal.pone.0133321. PMID: 26196125.
    2. Motorin Y, Burhenne J, Teimer R, Koynov K, Willnow S, Weinhold E, Helm M. Expanding the chemical scope of RNA:methyltransferases to site-specific alkynylation of RNA for click labeling. Nucleic Acids Res. 2011 Mar ; 39(5):1943-52. doi: 10.1093/nar/gkq825. PMID:21037259.
  • Etude et caractérisation de pseudouridines-synthases
    1. Behm-Ansmant I, Branlant C, Motorin Y. The Saccharomyces cerevisiae Pus2 protein encoded by YGL063w ORF is a mitochondrial tRNA:Psi27/28-synthase. RNA.2007 Oct ; 13(10):1641-7. PMID: 17684231.
    2. Behm-Ansmant I, Massenet S, Immel F, Patton JR, Motorin Y, Branlant C. A previously unidentified activity of yeast and mouse RNA:pseudouridine synthases 1 (Pus1p) on tRNAs. RNA. 2006 Aug ; 12(8):1583-93. PMID:16804160.

Publications

enseignements

Formations

  • Depuis ma nomination en 2000, j'assure environ 220-250 h / EqTD d'enseignements annuel dans les filières de Licence et Master de Biochimie et Biologie Moléculaire de l'Université de Lorraine.
  • Depuis 2013, j'ai créé une filière internationale avec un enseignement exclusivement en anglais de niveau M2 RNAES (RNA Enzyme Sciences) dans le cadre du Master BSIS à l'Université de Lorraine, et j'assure la direction de cette formation. Actuellement, cette filière internationale accueille 15-18 étudiants par année, répartis en 2 options (RNA et Enzyme), l'effectif est composé d'étudiants français (1/3) et des étrangers anglophones (2/3).

Responsabilités

  • Membre du conseil de l'UFR STB (actuellement Secteur Biologie) (2002-2009)
  • Membre du conseil du Secteur Biologie (2010-2015)
  • Membre du conseil de la Pédagogie de l'UFR (2002-2010)
  • Membre de la commission des spécialistes 64ème section de l'UHP (2001-2008)
  • Membre du conseil de la Faculté de Sciences et Technologies (2011-2015)
  • Membre du Collégium Sciences et Technologies de UL (2011-2017)