Présentation

  • Séquençage à haut-débit, Génotypage haut-débit, Méthylome

    La plateforme de Génomique Fonctionnelle créée en 2012 s’appuie sur les compétences de l’UMR1256 n-GERE en matière de séquençage NGS des patients atteints de maladies rares.

    La plateforme met à disposition de la communauté scientifique, académique et industrielle des outils de haute technologie adaptée aux projets de :

    • Génotypage haut débit sur puces BeadChip Infinium Illumina.
    • Etude de la méthylation du génome humain sur puces Infinium Methylation EPIC-Illumina.
    • Préparation et séquençage NGS de librairies d’ADN (séquenceur MiSeq-Illumina, prochainement NextSeq 550-Illumina).
    • Analyse bioinformatique des données omiques.

Accès et tarifs

  • La plateforme est ouverte à la communauté scientifique, académique et industrielle.

    Elle est à votre disposition pour vous accompagner de A à Z dans vos projets.

    La plateforme dispose d’une tarification différentielle (membres, laboratoires académiques et partenaires industriels). Nous consulter.

Publications

  • Alix T, Chéry C, Josse T, Bronowicki JP, Feillet F, Guéant-Rodriguez RM, Namour F, Guéant JL, Oussalah A. Predictors of the utility of clinical exome sequencing as a first-tier genetic test in patients with Mendelian phenotypes: results from a referral center study on 603 consecutive cases. Hum Genomics. 2023 Feb 5;17(1):5.
    logo DOI - Digital Object Identifier 10.1186/s40246-023-00455-x , Logo PMID - PubMed 36740706
  • Oussalah A, Siblini Y, Hergalant S, Chéry C, Rouyer P, Cavicchi C, Guerrini R, Morange PE, Trégouët D, Pupavac M, Watkins D, Pastinen T, Chung WK, Ficicioglu C, Feillet F, Froese DS, Baumgartner MR, Benoist JF, Majewski J, Morrone A, Rosenblatt DS, Guéant JL. Epimutations in both the TESK2 and MMACHC promoters in the Epi-cblC inherited disorder of intracellular metabolism of vitamin B12. Clin Epigenetics. 2022 Apr 19;14(1):52.

    logo DOI - Digital Object Identifier 10.1186/s13148-022-01271-1 , Logo PMID - PubMed 35440018
  • Guéant JL, Chéry C, Oussalah A, Nadaf J, Coelho D, Josse T, Flayac J, Robert A, Koscinski I, Gastin I, Filhine-Tresarrieu P, Pupavac M, Brebner A, Watkins D, Pastinen T, Montpetit A, Hariri F, Tregouët D, Raby BA, Chung WK,  Morange PE, Froese DS, Baumgartner MR, Benoist JF, Ficicioglu C, Marchand V, Motorin Y, Bonnemains C, Feillet F, Majewski J, Rosenblatt DS. APRDX1 mutant allele causes a MMACHC secondary epimutation in cblC patients. Nat Commun. 2018 Jan 4 ; 9(1):67.

    logo DOI - Digital Object Identifier 10.1038/s41467-017-02306-5 , Logo PMID - PubMed 29302025 , logo HAL - Archives Ouvertes HAL-01801484

contact

  • Service Mutualisé de Plateformes (SMP) - UMR1256 NGERE
    Bâtiment C, 2ème étage, Campus Brabois-Santé
    9 Avenue de la Forêt de Haye, BP 20199
    54505 VANDOEUVRE-LES-NANCY