Plateforme
Biophysique & Biologie Structurale (B2S)
NMR
Le spectromètre RMN est équipé d’une cryosonde TCI triple résonance 1H, 13C et 15N avec gradient de champ statique selon l’axe Z et blindage actif. La cryosonde est refroidie sur les noyaux 1H et 13C, permettant ainsi un gain de sensibilité qui peut atteindre un facteur de 4 à 8 par rapport à une sonde classique. Elle peut fonctionner dans l’intervalle de température de 0 à +60°C.
Ce dispositif est adapté à l’étude de la structure 3D et de la dynamique des protéines, des acides nucléiques et des interactions protéine/ligand (antigène/anticorps, enzyme/substrat …), mais aussi à l’analyse de liquides biologiques, de molécules organiques de synthèse, de polymères chimiques, etc.
Le spectromètre de RMN est équipé d’une station de travail PC sous Linux, avec le logiciel TopSpin 3.2.
Plusieurs prestations sont disponibles : Caractérisation des protéines, peptides, ARN et molécules organique en solution ; Caractérisation des interactions récepteur-ligand ; Contrôle qualité de molécule en solution aqueuse ou organique…
- Demande de prestation116.03 Ko
- Charte des utilisateurs245.46 Ko
Les analyses peuvent être réalisées en mode service ou en mode collaboration en fonction des demandes et de l'implication des membres de la plateforme. Contacter le responsable à l'aide du formulaire de "Demande de prestation" pour plus de renseignements.
- Dos Santos Morais R, Santo PE, Ley M, Schelcher C, Abel Y, Plassart L, Deslignière E, Chagot ME, Quinternet M, Paiva ACF, Hessmann S, Morellet N, M F Sousa P, Vandermoere F, Bertrand E, Charpentier B, Bandeiras TM, Plisson-Chastang C, Verheggen C, Cianférani S, Manival X. Deciphering cellular and molecular determinants of human DPCD protein in complex with RUVBL1/RUVBL2 AAA-ATPases. J Mol Biol. 2022 Jul 25.
10.1016/j.jmb.2022.167760 , 
35901867 , 
HAL-03745381 Chagot ME, Boutilliat A, Kriznik A, Quinternet M. Structural Analysis of the Plasmodial Proteins ZNHIT3 and NUFIP1 Provides Insights into the Selectivity of a Conserved Interaction. Biochemistry. 2022 Mar 22.
10.1021/acs.biochem.1c00792 ,
35315277 ,
HAL-03617333 - Abel Y, Charron C, Virciglio C, Bourguignon-Igel V, Quinternet M, Chagot ME, Robert MC, Verheggen C, Branlant C, Bertrand E, Manival X, Charpentier B, Rederstorff M. The interaction between RPAP3 and TRBP reveals a possible involvement of the HSP90/R2TP chaperone complex in the regulation of miRNA activity. Nucleic Acids Res. 2022 Feb 28;50(4):2172-2189.
10.1093/nar/gkac086 ,
35150569 ,
HAL-03583324
Motorin Y, Quinternet M, Rhalloussi W, Marchand V. Constitutive and variable 2'-O-methylation (Nm) in human ribosomal RNA. RNA Biol. 2021 Sep 10:1-10.
10.1080/15476286.2021.1974750 ,
34503375 ,
HAL-03341858 - Bragantini B, Charron C, Bourguet M, Paul A, Tiotiu D, Rothé B, Marty H, Terral G, Hessmann S, Decourty L, Chagot ME, Strub JM, Massenet S, Bertrand E, Quinternet M, Saveanu C, Cianférani S, Labialle S, Manival X, Charpentier B. The box C/D snoRNP assembly factor Bcd1 interacts with the histone chaperone Rtt106 and controls its transcription dependent activity. Nat Commun. 2021 Mar 25;12(1):1859.
10.1038/s41467-021-22077-4 ,
33767140 ,
HAL-03181046
Dermouche S, Chagot ME, Manival X, Quinternet M. Optimizing the First TPR Domain of the Human SPAG1 Protein Provides Insight into the HSP70 and HSP90 Binding Properties. Biochemistry. 2021 Mar 19.
10.1021/acs.biochem.1c00052 ,
33739091 ,
HAL-03175986 - Abel Y, Paiva ACF, Bizarro J, Chagot ME, Santo PE, Robert MC, Quinternet M, Vandermoere F, Sousa PMF, Fort P, Charpentier B, Manival X, Bandeiras TM, Bertrand E, Verheggen C. NOPCHAP1 is a PAQosome cofactor that helps loading NOP58 on RUVBL1/2 during box C/D snoRNP biogenesis. Nucleic Acids Res. 2021 Jan 25;49(2):1094-1113.
10.1093/nar/gkaa1226 ,
33367824 ,
HAL-03070334
- Chagot ME, Quinternet M, Manival X, Lebars I. Application of NMR Spectroscopy to Determine the 3D Structure of Small Non-Coding RNAs. Methods Mol Biol. 2021;2300:251-266.
10.1007/978-1-0716-1386-3_19 ,
33792884 ,
HAL-03203667
Chagot ME, Quinternet M, Jacquemin C, Manival X, Gardiennet C. Box C/D snoRNPs: solid-state NMR fingerprint of an early-stage 50 kDa assembly intermediate. Biomol NMR Assign. 2020 Feb 6.
10.1007/s12104-020-09933-y ,
32030621 ,
HAL-02480749 Giraud T , Bouguet-Bonnet S , Marchal P , Pickaert G , Averlant-Petit MC , Stefan L. Improving and fine-tuning the properties of peptide-based hydrogels via incorporation of peptide nucleic acids. Nanoscale. 2020 Oct 14;12(38):19905-19917.
10.1039/d0nr03483e ,
32985645 - Risser F, Collin S, Dos Santos-Morais R, Gruez A, Chagot B, Weissman KJ. Towards improved understanding of intersubunit interactions in modular polyketide biosynthesis: docking in the enacyloxin IIa polyketide synthase. J Struct Biol. 2020 Jul 25.
10.1016/j.jsb.2020.107581 ,
32717326
Chagot ME, Dos Santos Morais R, Dermouche S, Lefebvre D, Manival X, Chipot C, Dehez F, Quinternet M. Binding properties of the quaternary assembly protein SPAG1. Biochem J. 2019 May 22.
10.1042/BCJ20190198 ,
31118266 ,
HAL-02140524 Chagot ME, Quinternet M, Rothé B, Charpentier B, Coutant J, Manival X, Lebars I. The yeast C/D box snoRNA U14 adopts a "weak" K-turn like conformation recognized by the Snu13 core protein in solution. Biochimie. 2019 Mar 23.
10.1016/j.biochi.2019.03.014 ,
30914254 ,
HAL-02082477 Bragantini B, Rouillon C, Charpentier B, Manival X, Quinternet M. NMR assignment and solution structure of the external DII domain of the yeast Rvb2 protein. Biomol NMR Assign. 2018 Oct ; 12(2):243-247.
10.1007/s12104-018-9816-5 ,
29569106 ,
HAL-01882005 Maurizy C, Quinternet M, Abel Y, Verheggen C, Santo PE, Bourguet M, Paiva A, Bragantini B, Chagot ME, Robert MC, Abeza C, Fabre P, Fort P, Vandermoere F,Sousa P Rain JC, Charpentier B, Cianférani S, Bandeiras TM, Pradet-Balade B, Manival X, Bertrand E. The RPAP3-Cterminal domain identifies R2TP-like quaternary chaperones. Nat Commun. 2018 May 29 ; 9(1):2093.
10.1038/s41467-018-04431-1 ,
29844425 ,
HAL-01872981 Henri J, Chagot ME, Bourguet M, Abel Y, Terral G, Maurizy C, Aigueperse C, Georgescauld F, Vandermoere F, Saint-Fort R, Behm-Ansmant I, Charpentier B, Pradet-Balade B, Verheggen C, Bertrand E, Meyer P, Cianférani S, Manival X, Quinternet M. Deep Structural Analysis of RPAP3 and PIH1D1, Two Components of the HSP90 Co-chaperone R2TP Complex. Structure. 2018 Sep 4 ; 26(9):1196-1209.
10.1016/j.str.2018.06.002 ,
30033218 ,
HAL-01919243 Kriznik A, Yéléhé-Okouma M, Lec JC, Groshenry G, Le Cordier H, Charron C, Quinternet M, Mazon H, Talfournier F, Boschi-Muller S, Jouzeau JY, Reboul P. CRDSAT Generated by pCARGHO: A New Efficient Lectin-Based Affinity Tag Method for Safe, Simple, and Low-Cost Protein Purification. Biotechnol J. 2018 Oct 8:e1800214.
10.1002/biot.201800214 ,
30298550 ,
HAL-01892441 Dorival J, Risser F, Jacob C, Collin S, Dräger G, Paris C, Chagot B, Kirschning A, Gruez A, Weissman KJ. Insights into a dual function amide oxidase/macrocyclase from lankacidin biosynthesis. Nat Commun. 2018 Sep 28 ; 9(1):3998.
10.1038/s41467-018-06323-w ,
30266997 ,
HAL-01980537
