"EpiRNA-Seq" (Epitranscriptomics and RNA Sequencing) est la nouvelle appellation de la plateforme de séquençage à haut-débit (NGS). Elle va permettre de mieux valoriser les activités phares développées par la plateforme dans le domaine de l'épitranscriptomique (étude des modifications post-transcriptionnelles des ARN). Coup de projecteur sur cette spécialisation unique en France et en Europe...

L'épitranscriptome, c'est quoi et pourquoi c'est important ?

Les ARN sont modifiés après leur transcription, ainsi en plus des bases canoniques de l'ARN (A, C, G, U), des additions de groupements chimiques ou des créations de nouvelles bases vont avoir lieu principalement par l'action d'enzymes ou de particules ribonucléoprotéiques. Actuellement, il existe plus de 120 modifications et il est admis que certaines d'entre elles participent à la régulation fine de l'expression des gènes et jouent un rôle dans l'efficacité et la fidélité de la traduction. Elles pourraient même servir comme biomarqueurs de maladies (cancer, maladies rares, ...), du vieillissement ou dans l'immunité. Leur cartographie et leur quantification par le séquençage à haut-débit est devenu donc essentiel pour une meilleure compréhension de ces mécanismes biologiques.

La plateforme possède une expertise unique dans la manipulation des ARN et a développé ses propres approches méthodologiques dans le domaine de l'épitranscriptomique pour les mettre à disposition de la communauté scientifique

L'expertise de la plateforme EpiRNA-Seq repose sur une expérience unique et reconnue dans la manipulation des ARN.

La plateforme a développé ses propres méthodologies permettant de cartographier et de quantifier les résidus 2'-O-méthylés (Nm), 7 méthylguanosine (m⁷G) et 3 méthylcytosine (m³C). Pour vous accompagner dans tous vos projets, elle se propose de prendre en charge différentes étapes en commencant par l'extraction des ARN, leurs traitements par des réactifs chimiques, et la préparation des banques de séquençage dédiées. Ces modifications sont principalement étudiées dans les ARN abondants (ARN ribosomiques ou ARN de transfert) mais peuvent aussi l'être au niveau du transcriptome (ARNm et lncARN). Sa combinaison aux technologies de pointe (plateforme de séquençage Illumina), et à des pipelines exclusifs en bioinformatique régulièrement adaptés aux projets et sans cesse améliorés, vous garantissent des analyses performantes et de grande qualité.

De plus, la plateforme continue à développer de nouvelles approches innovantes en recherche pour détecter d'autres types de nucléotides modifiés par séquençage à haut-débit afin de les mettre à disposition de la communauté scientifique le plus rapidement possible.

La plateforme EpiRNA-Seq organise également des formations théoriques et pratiques à destination des chercheurs, étudiants ou personnels techniques sur la détection et la quantification des nucléotides modifiés au sein des ARN. La prochaine session aura lieu en novembre 2019.

Malgré la spécialisation de la plateforme en épitranscriptomique, nous traitons également vos projets de transcriptomique (RNA-seq et miRNA-seq).

Si vous souhaitez obtenir plus de renseignements, n'hésitez pas à nous contacter : ibslor-ngs-contact [chizindikiro] univ-lorraine [mfundo] fr

Pour vous inscrire à la formation Epitranscriptomique : Formation CNRS-Entreprises