- Plateforme
Génomique fonctionnelle
- Séquençage à haut-débit, Génotypage haut-débit, Méthylome
Créée en 2012, la plateforme de Génomique Fonctionnelle accompagne les projets de recherche translationnelle, de génomique clinique et d’épigénomique en proposant des solutions d’analyses omiques de pointe.
La plateforme met à disposition des technologies de génotypage, d’analyse du méthylome et de séquençage à haut débit (NGS), associées à un accompagnement scientifique et technique personnalisé. Son expertise couvre l’ensemble du cycle de vie des projets, depuis leur conception jusqu’à la production et l’analyse des données.
Nos expertises :
- Accompagnement scientifique et technique des projets
- Ingénierie de projet et conception des stratégies analytiques
- Profilage de la méthylation de l’ADN à l’échelle pangénomique sur puce et par séquençage NGS
- Génotypage haut débit sur puce
- Séquençage à haut-débit (NGS, 2e génération)
En s’appuyant sur des technologies robustes et une expertise reconnue, la plateforme contribue au développement de projets innovants en génomique et épigénomique au service de la recherche biomédicale et de la médecine de précision.
La plateforme est ouverte à la communauté scientifique académique et industrielle au niveau local, national et international.
L'équipe est à votre disposition pour vous aider en apportant ses savoir-faires techniques et méthodologiques et vous accompagner de A à Z dans vos projets.
La plateforme dispose d'une tarification différentielle (Université de Lorraine, partenaires académiques et industriels).
Tout nouveau collaborateur doit remplir le formulaire de "Demande de prestation" afin de définir la meilleure stratégie à adopter pour la conduite de l’étude, et obtenir un devis. Tout utilisateur s’engagera à accepter les conditions générales (charte des utilisateurs).
- Alix T, Chéry C, Josse T, Bronowicki JP, Feillet F, Guéant-Rodriguez RM, Namour F, Guéant JL, Oussalah A. Predictors of the utility of clinical exome sequencing as a first-tier genetic test in patients with Mendelian phenotypes: results from a referral center study on 603 consecutive cases. Hum Genomics. 2023 Feb 5;17(1):5.
10.1186/s40246-023-00455-x , 
36740706 Oussalah A, Siblini Y, Hergalant S, Chéry C, Rouyer P, Cavicchi C, Guerrini R, Morange PE, Trégouët D, Pupavac M, Watkins D, Pastinen T, Chung WK, Ficicioglu C, Feillet F, Froese DS, Baumgartner MR, Benoist JF, Majewski J, Morrone A, Rosenblatt DS, Guéant JL. Epimutations in both the TESK2 and MMACHC promoters in the Epi-cblC inherited disorder of intracellular metabolism of vitamin B12. Clin Epigenetics. 2022 Apr 19;14(1):52.
10.1186/s13148-022-01271-1 ,
35440018 Guéant JL, Chéry C, Oussalah A, Nadaf J, Coelho D, Josse T, Flayac J, Robert A, Koscinski I, Gastin I, Filhine-Tresarrieu P, Pupavac M, Brebner A, Watkins D, Pastinen T, Montpetit A, Hariri F, Tregouët D, Raby BA, Chung WK, Morange PE, Froese DS, Baumgartner MR, Benoist JF, Ficicioglu C, Marchand V, Motorin Y, Bonnemains C, Feillet F, Majewski J, Rosenblatt DS. APRDX1 mutant allele causes a MMACHC secondary epimutation in cblC patients. Nat Commun. 2018 Jan 4 ; 9(1):67.
10.1038/s41467-017-02306-5 ,
29302025 , 
HAL-01801484
