Thématique
de recherche

• Techniques à haut-débit pour l'étude des nucléotides modifiés (Epitranscriptomique) : Développements de méthodes pour identifier les nucléotides modifiés au sein des ARN par des techniques à haut-débit (RiboMethSeq, AlkAniline-Seq, HydraPsiSeq,...)

Résultats
majeurs

• Développement de techniques à haut-débit pour l'étude des nucléotides modifiés
  • Marchand V, Pichot F, Neybecker P, Ayadi L, Bourguignon-Igel V, Wacheul L, Lafontaine DLJ, Pinzano A, Helm M, Motorin Y. HydraPsiSeq: a method for systematic and quantitative mapping of pseudouridines in RNA. Nucleic Acids Res. 2020 Sep 25 : gkaa769. doi:10.3390/genes11080950
  • Ringeard M, Marchand V, Decroly E, Motorin Y, Bennasser Y. FTSJ3 is an RNA 2'-O-methyltransferase recruited by HIV to avoid innate immune sensing. Nature. 2019 Jan 9. doi: 10.1038/s41586-018-0841-4.
  • Marchand V, Ayadi L, Ernst FGM, Hertler J, Bourguignon-Igel V, Galvanin A, Kotter A, Helm M, Lafontaine DLJ, Motorin Y. AlkAniline-Seq: Profiling of m(7)G and m(3)C RNA Modifications at Single Nucleotide Resolution. Angew Chem Int Ed Engl. 2018 Dec 17;57(51):16785-16790. doi:10.1002/anie.201810946.
  • Marchand V, Blanloeil-Oillo F, Helm M, Motorin Y. Illumina-based RiboMethSeq approach for mapping of 2'-O-Me residues in RNA. Nucleic Acids Res. 2016 Sep19;44(16):e135. doi:10.1093/nar/gkw547.

• Etude des facteurs en cis impliqués dans la localisation et le contrôle traductionnel de l’ARNm oskar chez la Drosophile
  • Ghosh S, Obrdlik A, Marchand V, Ephrussi A. The EJC binding and dissociating activity of PYM is regulated in Drosophila. PLoS Genet. 2014 Jun 26;10(6):e1004455. doi:10.1371/journal.pgen.1004455.
  • Ghosh S*, Marchand V*, Gáspár I, Ephrussi A. Control of RNP motility and localization by a splicing-dependent structure in oskar mRNA. Nat Struct Mol Biol. 2012 Mar 18;19(4):441-9. doi:10.1038/nsmb.2257. *=co-first authors
  • Marchand V, Gaspar I, Ephrussi A. An intracellular transmission control protocol: assembly and transport of ribonucleoprotein complexes. Curr Opin Cell Biol. 2012 Apr;24(2):202-10. doi:10.1016/j.ceb.2011.12.014. Review.

• Etude des mécanismes de régulation de l’épissage des ARN de deux rétrovirus, le virus du Sarcome de Rous (RSV) et le virus responsable de l’immunodéficience humaine (HIV-1)
  • Marchand V*, Santerre M*, Aigueperse C, Fouillen L, Saliou JM, Van Dorsselaer A, Sanglier-Cianférani S, Branlant C, Motorin Y. Identification of protein partners of the human immunodeficiency virus 1 tat/rev exon 3 leads to the discovery of a new HIV-1 splicing regulator, protein hnRNP K. RNA Biol. 2011 Mar-Apr;8(2):325-42. PMID: 21368586. *=co-first authors
  • Bar A, Marchand V, Khoury G, Dreumont N, Mougin A, Robas N, Stévenin J, Visvikis A, Branlant C. Structural and functional analysis of the Rous Sarcoma virus negative regulator of splicing and demonstration of its activation by the 9G8 SR protein. Nucleic Acids Res. 2011 Apr;39(8):3388-403. doi:10.1093/nar/gkq1114.
  • Marchand V, Méreau A, Jacquenet S, Thomas D, Mougin A, Gattoni R, Stévenin J, Branlant C. A Janus splicing regulatory element modulates HIV-1 tat and rev mRNA production by coordination of hnRNP A1 cooperative binding. J Mol Biol. 2002 Nov 1;323(4):629-52. PMID: 12419255.

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